Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ECH1Q13011 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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