Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KIF5AQ12840 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.9 ms