Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPREP23469 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPREP23469 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPREP23469 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPREP23469 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPREP23469 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPREP23469 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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