Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRBP23467 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms