Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PITPNM1O00562 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PITPNM1O00562 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms