Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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