Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms