Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Q1T7F1 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Q1T7F1 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Q1T7F1 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Q1T7F1 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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