Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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CDO1Q16878 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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