Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ME3Q16798 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ME3Q16798 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ME3Q16798 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms