Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
LAMA3Q16787 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms