Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDK4Q16654 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDK4Q16654 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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PDK4Q16654 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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PDK4Q16654 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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PDK4Q16654 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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PDK4Q16654 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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PDK4Q16654 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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PDK4Q16654 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDK4Q16654 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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