Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD8Q15843 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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