Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms