Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIP13Q15645 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIP13Q15645 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms