Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TAF1AQ15573 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms