Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SYCP1Q15431 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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