Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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