Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMC1AQ14683 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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