Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms