Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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