Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CDH18Q13634 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CDH18Q13634 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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