Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PEX6Q13608 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms