Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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TCOF1Q13428 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TCOF1Q13428 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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