Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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