Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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