Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CBX3Q13185 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CBX3Q13185 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CBX3Q13185 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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CBX3Q13185 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CBX3Q13185 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CBX3Q13185 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CBX3Q13185 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CBX3Q13185 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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CBX3Q13185 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CBX3Q13185 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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