Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MRPL28Q13084 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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