Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NFX1Q12986 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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