Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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NFIAQ12857 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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NFIAQ12857 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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