Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPREB1P12018 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms