Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRCP08575 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRCP08575 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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