Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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