Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms