Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SAMD8Q96LT4 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms