Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMARCE1Q969G3 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms