Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TDRD12Q587J7 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
TDRD12Q587J7 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms