Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms