Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF239Q16600 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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