Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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CNGA3Q16281 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CNGA3Q16281 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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