Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK4Q16099 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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