Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF56Q15929 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms