Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms