Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCDC85BQ15834 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC85BQ15834 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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