Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
NPTX1Q15818 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NPTX1Q15818 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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