Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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HMGN3Q15651 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
HMGN3Q15651 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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