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| ZNHIT3 | Q15649 | RNU2-36P-201 | ENST00000410361 | 191 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AL391987.6-201 | ENST00000305671 | 199 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | RNU1-62P-201 | ENST00000362599 | 164 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.116-201 | ENST00000363292 | 103 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-1257P-201 | ENST00000384625 | 110 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | ITGA9-AS1-208 | ENST00000449586 | 726 nt | TSL 3 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC026904.2-201 | ENST00000521359 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ACTG1P17-203 | ENST00000561222 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC023813.2-201 | ENST00000564321 | 469 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | LINC01195-201 | ENST00000570118 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MTND4LP25-201 | ENST00000570218 | 163 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC007948.1-201 | ENST00000581632 | 242 nt | TSL 5 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RBBP8-210 | ENST00000581687 | 617 nt | TSL 2 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | GALNT1-205 | ENST00000591081 | 1120 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL355472.4-201 | ENST00000610233 | 626 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | FRG1KP-201 | ENST00000623592 | 341 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ZGRF1-208 | ENST00000505019 | 6652 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | PPP1R3A-201 | ENST00000284601 | 4384 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL161668.1-201 | ENST00000320322 | 358 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.118-201 | ENST00000363300 | 101 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SMIM11P1-201 | ENST00000369586 | 178 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | FAM206A-202 | ENST00000374624 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | KIF27-203 | ENST00000376347 | 1030 nt | TSL 5 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.472-201 | ENST00000384322 | 102 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TRAJ39-201 | ENST00000390498 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL109924.3-201 | ENST00000413324 | 393 nt | TSL 2 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL365338.1-201 | ENST00000422282 | 858 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |