Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNHIT3Q15649 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNHIT3Q15649 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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