Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRKQ15262 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms