Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.56□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NECTIN1Q15223 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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