Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms